Fundada en abril de 1965 en la ciudad de Santo Domingo con el propósito de elaborar panes y repostería con la más alta tecnología de la época. Pepín fue pionero en el desarrollo del pan de sándwich y otros productos en el país. Esta larga trayectoria, el dedicado esfuerzo de calidad y servicio de todo su equipo hacen que Pan Pepín continúe siendo hoy la marca en panificación de mayor tradición y prestigio en Republica Dominicana.
A finales del 1998 pasa a formar parte de Grupo Malla como estrategia de su expansión de productos derivados de la harina. En noviembre del 2002 Grupo Malla pasó a formar parte de la multinacional Guatemalteca Molinos Modernos.
En 2010 Pan Pepín S.A pasó de nuevo a ser una empresa independiente. Inicia a si la modernización de la planta física e industrial, que la reponen a la vanguardia tecnológica de la industria panadera de República Dominicana y El Caribe.